有机肥料的生产一般都必须经过堆肥发酵过程。堆肥是在一定条件下通过微生物的作用，使有机物不断被降解和稳定，并产出一种适宜于土地利用的产品的过程。堆肥过程中各有机物在微生物作用下，达到不易分解、稳定、作物易吸收状态；同时微生物作用在一定范围内减少重金属毒害作用。可见，堆肥是制造生物有机肥的简便而有效的方法，有益于生态农业的发展。

经此过程的堆肥可以达到三个目的，一是无害化；二是腐殖质化；三是大量微生物代谢产物如各种抗生素、蛋白类物质等。

用以前堆肥发酵的方法时间长、味道重，现在用发酵设备来发酵，发酵时间短（8—10小时完全发酵）、占地面积小（以年产1万吨为例只需发酵面积30平方米），运输维修保养方便快捷的有机肥快速发酵罐，大大提高了生产效率及清洁式作业环境。使有机肥生产更加快捷，为有机肥工厂化生产更加实用化。

河南通达重工科技有限公司设计的有机肥发酵设备，实现了固体有机废弃物池式好氧连续发酵的集成创新，广泛应用于畜禽饲养、酿造、制糖、造纸、城市污泥等行业的有机废弃物的无害化处理。